Predavatelj izr. prof. dr. Andrej Blejec
Kabinet Biološko Središče, Z.2.18
Govorilne ure Tor, 13:00 - 14:00
Vpis ocen Ocene vpisuje prof. dr. Anderluh
Naloga 1: Uporaba R - pokaziKajZnas.pdf
Izpiti
Seznam izpitnih rokov je objavljen v ŠIS in na Moodle
| Predavanja: | Sreda | 13:00 | - 14:00 | |
| Vaje | Torek | 13:00 | - 16:00 | |
| Sreda | 14:00 | - 17:00 | ||
| Četrtek | 09:00 | - 12:00 | ||
Spletna učilnica Moodle
Baze podatkov: BazePodatkovA.pdf
Primeri uporabe R v bioinformatiki compBiol.pdf, Programski ukazi: compBiol.R
Uporaba R v Bioinformatiki (2. del) UporabaR2S.pdf, Programski ukazi: UporabaR2.R
Manipulacija nizov znakov stringsS.pdf, strings.R
Povezava s KEGG KEGG-anotacija.pdf, Programski ukazi: KEGG-anotacija.R
Primerjava zaporedij - Točkovni graf (dotPlot): dotplot.pdf, Programski ukazi: dotplot.R
Perl PerlS.pdf
Baze podatkov
BazePodatkovS.pdf,
BazePodatkov.R, BazePodatkovA.pdf
FASTA.pdf, FASTA.R
Knjiga: Knjiga.pdf
Seznam in opis pogosteje uporabljenih ukazov v R: Rcard.pdf
Vaje iz R:
- Bioinf-vaje.pdf
- Poglavje iz knjige: Chapter-4.pdf (geslo je enako, kot ga imate za računalnike v B6).
Vaje za MySQL
Datoteka za brisanje tabel v bazi, drop.txt
Prekopirajte jo na disk H: in v MySQL napišite ukaz: SOURCE
h:/drop.txt
tako pripravite bazo za naslednjo skupino. Ta ukaz lahko poženete tudi
preden začnete s kreiranjem tabel.