R

animatoR - my presentation at useR! 2001 conference in Warwick.
The package animatoR for support of dynamic graphics will be avaliable soon at CRAN

Tule se zbirajo dokumenti v zvezi z uporabo R

Osnovna povezava http://www.r-project.org
CRAN Task views - pregled paketov po področjih uporabe
Jonathan Baron's R help page
RSeek.org R-project Search Engine - učinkovit vmesnik za iskanje po R straneh
r-project and bioconductor code search iskanje po R, CRAN, Bioconductor
R bloggers
RStudio - zelo obetaven in brezplačen uporabniški vmesnik za R
se razvija - oglati predklepaj (pa se kaj) deluje v verziji
RStudio Beta 2 (v0.93, 11. april 2011)

Na tej strani:

Sweave
R + LaTeX = Sweave : predavanje na IBMI 19. 5. 2008 Blejec-Sweave-080519.pdf
MVA - seminarji iz multivariatne analize
Moj Priročnik za R (Introduction to R, I2R)
Seznam pogostih ukazov
Nasveti za stil pisanja v R
R in Excel datoteke - definirana je funkcija read.xls s paketom RODBC (14. maj 2009)
Branje in zapisovanje datotek
HowTo - zbirka namigov
Datumske spremenljivke
Uporaba posebnih znakov in šumnikov v grafih ( … ‰ º € • µ )
Grafi z višjo ločljivostjo (.wmf in .png)
Demo - nekaj za pouk statistike ...
Simulacija trajanja faz celičnega cikla
Posnetek tečaja
SPSS in R
Izbor paketov
Povezave

Namig: R programske stavke in izpise v PDF datotekah lahko skupaj z oznakami "> " skopirate na clipboard in jih prenesete v R ukazno okno z uporabo izbire ’Edit/Paste commands only’

Sweave

Sweave povezuje R z LaTeX, in je učinkovito sredstvo za dokumentiranje analiz in pripravo poročil.
Sweave je osnova za zagotavljanje ponovljivosti raziskav (reproducible research).
Kratek primer je v poskus.pdf.

V grobem poteka stvar takole:

skozi Sweave pošljemo .Rnw datoteko	poskus.Rnw
ta naredi .tex datoteko	poskus.tex
iz nje pa pripravimo .pdf dokument	poskus.pdf

Kot stranski produkt dobimo še datoteko z vsemi R ukazi (Stangle)	poskus.R

Osnovna datoteka poskus.Rnw in vse druge so v datoteki poskus.zip

Za podrobnosti poiščite "Sweave" na RSeek.org R-project Search Engine
ali pa poglejte An Sweave Demo

R + LaTeX = Sweave

predavanje na IBMI 19. 5. 2008 Blejec-Sweave-080519.pdf

MVA

Priprava na seminarje iz multivariatne analize - podiplomski študij Statistika.

2007

"Multivariatne metode in manjkajoči podatki"
mva07.pdf (posodobljeno 4. 6. 2008)

Funkcije, potrebne za mva07 (tudi funkcije za risanje v treh dimenzijah, Graph3d.r) je potrebno naložiti pred delom.
V tej datoteki je npr funkcija "declareMissing"

R ukazi uporabljeni v mva07: mva07.R

Nekaj uporabnih paketov za MVA je naštetih v Izboru paketov

MCAR
za generiranje manjkajočih vrednosti sem pripravil še en zapis
missingValues.pdf , missingValues.R

2008

"Generiranje nenavadnih skupin podatkov"
MVA08.pdf (in njihova vizualizacija v treh dimenzijah - 3D)

MVA08.R

2009

"Kanonična korelacija"
MVA09.pdf

MVA09.R

Moj priročnik (v nastajanju, se spreminja)

Introduction to R

Dostop do datoteke bmiall.txt (vse datoteke s podatki so dostopne tule in v ZIP datoteki Data)

Zip datoteka (I2R.zip) vse datoteke s podatki, priročnik v PDF obliki in vse uporabljene ukaze (datoteke /doc/*.R). Priporočam, da vsebino razpnete v nek poddirektorij ( npr. C:/I2R ) in prestavite delovni direktorij na C:/I2R/R -- uporabite lahko ukaz: setwd("C:/I2R/R")

Nekaj uporabnih virov je tudi na ITAP in ECPR

Seznam pogostih ukazov

Rcard.pdf

Nasveti za stil pisanja v R

Za preglednost programov je pomemben čimenotnejši stil pisanja programov. Za namige si oglejte

R Coding Conventions
Google's R Style Guide

R in Excel datoteke

Izmenjava tabel med R in Excel v Excel domačem formatu:: xlsReadWrite.pdf

Paket xlsReadWrite ni več v seznamu paketov na CRAN.
V dokumentu je opisana rešitev z uporabo ODBC. Definirana je funkcija read.xls

Branje in zapisovanje datotek

Kako preberemo podatke v navadni text obliki, Excel ali SPSS? Kako zapišem tabelo na disk?

Predstavljeno na 2. sestanku Rkoholikov, 3. december 2009

Predavanje: HowTo-IOS.pdf, uporabljeni ukazi: HowTo-IO.R, podatki: HowTo-IO.zip.

Datumske spremenljivke

Nekaj napotkov za risanje grafov s časovnimi spremnljivkami spremenljivk

Date.pdf

Datoteka s podatki: datumi.xls

Uporaba posebnih znakov ( … č š ž ‰ º € • µ ) v grafiki

ASCII.pdf

Šumnike v grafih (pdf) lahko pravilno prikažemo s spremembo kodiranja encoding.
Tule je rešitev za neposredno risanje v pdf in za uporabo v Sweave
HowTo-UporabaSumnikovVGrafu.pdf, HowTo-UporabaSumnikovVGrafu.rnw

Grafi z višjo ločljivostjo (.wmf in .png)

HowTo make high resolution figures: HowToWMF.pdf
Slike: lineplot2.png, lineplot2.wmf, lineplot3.png

Demo

Galtonova plošča - Quincunx quincunx.pdf, quincunx.R

Minimum vsote odklonov od mediane, povprečja in geometrijske sredine
(dinamična grafika) mindev.pdf

New: Joint and marginal distributions / Robne in skupne porazdelitve /
JointS.pdf - slides, A4 article format, R commands file
Inspired by Lynne Billard lecture in Radenci, 2009.